生态学方法

此类方法主要是利用污染物引起的群落组成或结构变化及生态系统功能变化为指标监测环境污染状况。在未受污染的地区，生态系统处于自然状态，其功能与结构基本是稳定的。但是，当生态系统受到污染物的胁迫后，其物种组成可能发生变化：敏感物种消失，抗性物种增加，个别强抗性物种成为群落的优势种。随着结构的变化，生态系统功能也发生相应变化，包括能流（如种群和群落的生产率和核生化监测系统的辅助配套TQ-462KU呼吸率）、物质循环（如各种营养物质的生物地球化学循环）以及各种生态调节机制（如各种种间相互关系）的改变。生态系统结构与功能的变化可以用各种参数表述，而这些参数即可用作生物监测指标。

生理学方法

此类方法是利用污染物引起的生物个体行为、生长、发育以及各种生理变化为指标监测换金污染或变化状况。在一定的浓度范围内，污染物没有致死作用和致病作用，但可能干扰机体某些生理功能，使其偏离正常状态。例如，受到一定浓核生化监测系统的辅助配套TQ-462KU度污染物影响，动物的回避反应和游泳能力等行为反应，呼吸、耗氧量及生长率等生理反应或者酶活性和肝细胞的糖元转化等生化反应可能发生变化。污染物干扰生理学过程的重要特征之一是在不表现出外观损伤之前改变机体的生理代谢。